A contagem paralela que ocorreu em pelo menos metade dos 53 municípios, confirmou alguns dos resultados mais controversos. Por lei, uma cópia de edital é afixada do lado de fora da Assembleia de Voto logo que terminar a contagem dos votos.
Geralmente os editais são colados nas portas de salas de aulas. Isto serve para permitir aos interessados de ir consultar e copiar os resultados dos editais. Isto pode servir para verificar a precisão do processo da contagem a nível da cidade, provincial e nacional. As contagens paralelas são geralmente feitas pelos partidos políticos e observadores.
Quatro resultados controversos são confirmados pela contagem paralela.
Milange: É confirmada a vitória apertada da Frelimo
Gurúè: É confirmada a diferença de um voto entre os candidates.
Nacala: É confirmada a vitória folgada da Frelimo com mais de 85% de votos
Ilha de Moçambique: Apesar da fraude, é confirmada a vitória da Frelimo. Em nenhuma Assembleia de voto a Frelimo arrecadou abaixo de 63% dos votos. Mas há indicação de enchimento das urnas (quatro assembleias de voto com afluência acima de 88%). Houve acusação de votação múltipla – pessoas eram permitidas votar e sair sem molharem o dedo na tinta indelével e depois tornarem a votar noutro posto – e houve sete assembleias de voto com pelo menos 85% de votos para a Frelimo.